Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik4Q8BMF5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms