Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp1Q8BJQ2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp1Q8BJQ2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp1Q8BJQ2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp1Q8BJQ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp1Q8BJQ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp1Q8BJQ2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms