Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smarcal1Q8BJL0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smarcal1Q8BJL0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms