Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms