Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms