Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms