Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M10.2Q85ZW9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.2Q85ZW9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms