Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh8Q80Y20 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms