Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Srrm3Q80WV7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Srrm3Q80WV7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Srrm3Q80WV7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Srrm3Q80WV7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srrm3Q80WV7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Srrm3Q80WV7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Srrm3Q80WV7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Srrm3Q80WV7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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