Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcsk9Q80W65 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms