Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc1Q80VQ1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms