Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap100Q80VN0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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