Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pnma8aQ80VM8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms