Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sestd1Q80UK0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sestd1Q80UK0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms