Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp8Q80U87 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp8Q80U87 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp8Q80U87 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp8Q80U87 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp8Q80U87 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp8Q80U87 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp8Q80U87 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp8Q80U87 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp8Q80U87 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp8Q80U87 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms