Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS8

Sel1l3, Protein sel-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l3Q80TS8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sel1l3Q80TS8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sel1l3Q80TS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms