Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PhkbQ7TSH2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms