Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Clec4b1Q7TS58 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clec4b1Q7TS58 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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