Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LnpkQ7TQ95 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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LnpkQ7TQ95 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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LnpkQ7TQ95 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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LnpkQ7TQ95 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms