Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tigd3Q7TM95 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms