Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox11Q7M6Y2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox11Q7M6Y2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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