Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScocQ78YZ6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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