Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms