Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snd1Q78PY7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snd1Q78PY7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms