Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubfd1Q78JW9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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