Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Eci3Q78JN3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eci3Q78JN3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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