Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sned1Q70E20 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms