Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms