Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Topbp1Q6ZQF0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms