Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp34Q6ZQ93 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp34Q6ZQ93 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp34Q6ZQ93 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp34Q6ZQ93 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp34Q6ZQ93 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp34Q6ZQ93 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp34Q6ZQ93 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms