Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cnot1Q6ZQ08 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms