Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2eQ6VUP9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms