Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rhox8Q6VSS7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rhox8Q6VSS7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms