Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms