Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sarm1Q6PDS3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms