Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Bhlhb9Q6PB60 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms