Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC061212Q6P8K3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC061212Q6P8K3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms