Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc66Q6NS45 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms