Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NipblQ6KCD5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NipblQ6KCD5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NipblQ6KCD5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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NipblQ6KCD5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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NipblQ6KCD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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NipblQ6KCD5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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NipblQ6KCD5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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