Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms