Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sohlh1Q6IUP1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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