Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CltbQ6IRU5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms