Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Krt40Q6IFX3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt40Q6IFX3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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