Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms