Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pds5aQ6A026 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms