Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgd6Q69ZL1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgd6Q69ZL1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms