Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mysm1Q69Z66 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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