Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cntn4Q69Z26 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cntn4Q69Z26 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cntn4Q69Z26 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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