Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltcQ68FD5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltcQ68FD5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms