Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80dQ66JY2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80dQ66JY2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms